Hace tres meses en su mundo, Anne y Sasha abandonan la escuela por el cumpleaños de Anne. Justo cuando Anne está a punto de volver a casa, Sasha la convence de que vaya a ver a Marcy para obtener el regalo que ella le consiguió: una caja de música. En el presente y como continuación del episodio anterior, Anne of The Year, el capitán Mugre y su ejército entran en Bosque Verruga para invitar a las ranas a un banquete que celebra la reunión de Anne y Sasha. Después de que Anne lo acepta, todos se dirigen a Torre Sapo. Mientras las ranas disfrutan del banquete, Anne y Sasha pasan el rato en la habitación que Sasha ocupó durante su estadía en Amphibia. Después de hablar con un sapo soldado nervioso, Sprig se da cuenta de que el banquete es una trampa y que todos son prisioneros, lo que hace que las ranas se defiendan. Sasha le revela a Anne que el banquete era un plan para atraer a Hop Pop hasta la fortaleza y arrojarlo a un Atrapamoscas Gigante de Venus como castigo por inspirar rebeliones en el valle. Anne intenta rescatar a las ranas, pero todas son capturadas. Cuando Hop Pop es llevado a ser ejecutado, Anne, con la ayuda de Sprig, se enfrenta a Sasha y lo defiende. Mugre propone un duelo entre las chicas: si Anne gana, todas las ranas podrán irse; pero si Sasha gana, Hop Pop será ejecutado. Anne vence a Sasha, pero la fortaleza empieza a derrumbarse por los explosivos que colocó Wally. Mientras todos escapan de la torre, Anne intenta salvar a Sasha, pero ella se deja caer sintiéndose culpable por cómo trató a su mejor amiga y creyendo que Anne estará mejor sin ella. Mugre salva a Sasha y, tras derrumbarse la fortaleza, se muestra que Sasha quedó inconsciente, y Mugre y los demás sapos escapan. Sprig consuela a Anne con un abrazo mientras ella llora, seguido por Polly y Hop Pop. Después de regresar a Bosque Verruga, los Plantar se disculpan con Anne porque perdió a Sasha como amiga, pero Anne les dice que está bien porque los considera su familia y que mientras permanezcan juntos superarán cualquier cosa.

La serie cuenta las aventuras de Anne Boonchuy una egocentrica chica de 13 años. Después de robar un misterioso cofre del tesoro, ella es transportada mágicamente a Amphibia, una pantanosa y salvaje zona llena de personas-rana parlantes. Pronto conoce y se hace amiga de una joven rana aventurera llamada Sprig Plantar, que la guiará para ser una verdadera heroína, mientras descubre la primera verdadera amistad de su vida

Cuando la primavera llega a Wartwood, Anne, Sprig, Hop Pop y Polly deciden viajar a Newtopia, una metrópolis desmadejada localizada en el corazón de Amphibia, para encontrar respuestas a cómo traer a Anne de vuelta a casa. Como van a estar fuera por mucho tiempo, Hop Pop contrata a Chuck para proteger la casa durante su ausencia. Pero cuando descubre lo incapaz que es Chuck de tal tarea, Anne decide fortificar la casa ella misma usando una poción especial de Loggle para fortalecer las plantas, pero ignora la advertencia de no usar demasiado, lo que provoca que muten en un monstruo gigante que destruye la casa. Anne y los Plantar logran derrotarla, mientras Chuck arregla la casa rápidamente (siendo esta la razón por la que Hop Pop lo contrató en primer lugar). Con todo arreglado, los Plantar marchan a Newtopia.

La familia llega a Bittyburg, un pueblo rural literalmente pequeño donde sus ciudadanos diminutos se ven obligados a pagar sus impuestos a la despiadada rana proscrita Judro Hasselback (Keith Ferguson), cada vez que ella aparece en la ciudad. En sus ansias de tener una canción heroica escrita sobre él, Hop Pop decide enfrentarse a Judro, espantandola de la ciudad. Los habitantes de la ciudad le celebran hasta que Judro vuelve con el resto de la Banda Hasselback y su líder, Mama Hasselback (Jenifer Lewis). Hop Pop pierde contra Mamá y los Plantar son echados de la ciudad. Durante el camino, Hop Pop se da cuenta de que ser un héroe no va de cantos y elogios, sino sobre hacer lo correcto, y decide volver a Bittyburg para enfrentarse una vez más a los Hasselback. Hop Pop va ganando pero acaba perdiendo una vez más cuando Mama se da cuenta de que el resto de la familia le está ayudando. En respuesta a la derrota de Hop Pop, los habitantes del pueblo, liderados por el niño enfermo Bailey, se vuelven locos y se rebelan contra los Hasselback. Los Plantar continúan con su viaje a Newtopia mientras el robot de la fábrica los sigue.

Mientras Anne y Sprig conducen por la noche para que Hop Pop duerma, Polly, sintiéndose pequeña, intenta pasar el tiempo con ellos, pero están demasiado ocupados gestionando el viaje para prestarle atención y empeora las cosas para la familia varias veces. Durante una parada en una parada de camiones, Polly va a por papel higiénico para limpiar el camión (que Polly mojó antes en uno de sus intentos de estar con los demás) y oye a los demás miembros de la familia quejarse de sus acciones tras su espalda. Sintiéndose dolida, Polly deja una roca morada en su cubo, esperando que el cambiazo les ponga preocupados cuando vean que no está y que les haga disculparse con ella. Sin embargo, el resto de la familia no nota nada raro y la deja tirada sin saberlo. Al intentar conectar con los camioneros en la parada, descubre que la roca es en realidad un huevo de rocho que se comerá a todo el que vea, y que el resto de la familia está en peligro. Con la ayuda de Soggy Joe, Polly logra alcanzar al resto de la familia y logra salvarla electrocutando al rocho. Los Plantar se disculpan con Polly por lo que dijeron y se reconcilian, pero el vagón familiar está roto, por lo que Soggy Joe se ofrece remolcarse a la siguiente parada. Mientras lo hacen, Hop Pop les lee no solo a Polly, sino también a Sprig y hasta a Anne, el libro que Polly quería al principio que Hop Pop leyese - el cual ella disfruta pero Sprig y Anne encuentran bastante oscuro.

Hartos de las constantes peleas entre Sprig y Polly por las dos semanas que llevan de viaje, Anne y Hop Pop los echan del vagón y los obligan a tomar el Quarreler's Pass, un camino dividido en donde los viajeros desahogan sus frustraciones, para que así se reconcilien. Al principio, Sprig y Polly siguen discutiendo, pero luego se dan cuenta de que, si quieren salir del Quarreler's Pass con vida, deben trabajar juntos. Sin embargo, sus discusiones aún continúan hasta que se separan, atrayendo la atención de un proteo ciego de dos cabezas (Laila Berzins y Chris Wylde) que intenta comerse a los dos. Al esconderse del proteo, las dos cabezas resultan tener una voluntad propia cada una y discuten de la misma forma en la que Sprig y Polly discutieron antes de que fueran echados del vagón, causando que los dos se den cuenta de su error. Los dos trabajan juntos usando sus habilidades de mímica e imitación para distraer a las dos cabezas del proteo y que sigan discutiendo, dándoles tiempo para escapar. Al sobrevivir al Quarreler's Pass, se reúnen con Anne y Hop Pop y vuelven al vagón, para fortuna de Anne, quien no ha podido aguantar escuchar a Hop Pop darle advertencias para conseguir un novio.

Mientras Anne le mostraba a Sprig su película favorita, los frenos de Bessie se acaban dañando, causando que la familia acabe en Ribbitvale, una ciudad de alta clase donde habitan los ricos. En la ciudad se reencuentran con Wally, quien resulta venir de una familia rica y actuar de una forma completamente distinta a cómo le conocen en Wartwood. Cuando Anne, quien ya había conectado con Wally antes de dejar Wartwood, le pregunta sobre su doble vida, él le explica que, si su familia se entera de cómo es en Wartwood, renegarán de él y eso implicará abandonar a su mascota mariquita, Fiddleleaf. Anne decide mostrar a la familia de Wally un montaje que ella realizó sobre la vida de Wally en Wartwood, pero solo hace que su familia le prohíba volver a salir de Ribbitvale, causando que Wally le rete a su padre, Wigbert (Hugh Bonneville), a un duelo de Beast Polo para su libertad y que se enfade con Anne por empeorar su situación. En el desafío, Anne se ofrece ser el vehículo de Wally durante el desafío para ayudarle, y logran ganar en el último momento. Después del partido, Wally le explica a su padre que solo quería que su familia respetase cómo es y que no quiere necesariamente abandonar su vieja vida. Wigbert le revela a su hijo que, al igual que Wally tocaba el acordeón, él también tocaba el cántaron, y los dos celebrar su reconciliación junto a Anne y los Plantar hasta que son asustados por un pollo gigante.

Mientras Anne lamenta no haber encontrado a su otra amiga, Marcy, durante el viaje a Newtopia, los Plantar por fin llegan a la ciudad después de un mes de viaje, pero descubren que la entrada a la ciudad está cerrada debido a un ejército de hormigas, las Barbari-ants, que ha invadido la ciudad. Cuando la familia es asaltada por un grupo de ellas, son salvados por una salamandra que, en realidad, resulta ser Marcy. Cuando Anne y Marcy celebran su reencuentro, esta última es rápidamente aceptada por el resto de la familia, salvo Sprig, quien reacciona a Marcy con reservación, sobre todo después de lo que pasó con Sasha. Marcy decide ayudar a la familia a derrotar a las hormigas, llevándoles a su guarida para ahuyentar a su reina de Newtopia, ya que es la única forma de derrotarles. Debido a lo despistada que era Marcy en la Tierra, Anne se pone sobreprotectora con ella para su eventual frustración , quien le convence que, a pesar de ello, puede cuidar de sí misma. Cuando Sprig es comido por la reina de las hormigas durante la batalla, Marcy lo salva, causando que él también la acepte y se disculpe por pensar mal de ella, y la familia espanta a las hormigas, marcando su victoria. Con el ejército de hormigas desaparecido, los cinco entran a Newtopia y los Plantar son recibidos por Lady Olivia. Ya dentro de la ciudad, Anne le revela a Marcy su reencuentro con Sasha y el final desdichado del mismo, pero las dos reconocen que no pueden irse si no están todas, así que deciden encontrar a Sasha mientras siguen buscando la forma de volver a casa. Pero no se dan cuenta de que el rey Andrias, el rey de Newtopia y de Amphibia, parece tener un tipo de plan secreto, el cual involucra a las tres chicas.

Durante una comida en un restaurante en Newtopia, Anne, Marcy y los Plantar reciben un mensaje del Rey Andrias escrito en un código que deben descifrar resolviendo rompecabezas por toda Newtopia. Anne, Sprig y Marcy se embarcan en la búsqueda, pero cuando Hop Pop y Polly están a punto de seguirles, Hop Pop acaba encantado por la oferta de comida gratis, dejando a Polly para vigilarle. Durante la búsqueda, Anne le confiesa a Sprig que, mientras que antes Marcy era la despistada del grupo, ahora ella se siente estúpida a su lado, por lo que Sprig le sugiere intentar probar que es igual de lista que Marcy resolviendo los rompecabezas antes que ella, pero Marcy, que lleva mucho más tiempo en Newtopia que Anne, siempre logra descifrarlos antes. Durante sus intentos de demostrar que es igual de lista que Marcy, Anne acaba salvando a la mascota oruga de una niña pequeña llamada Efty (Brielle Milla) de un árbol, conecta con una anciana llamada Doris (Tress MacNeille) al intentar que le ayude a resolver uno de los rompecabezas, y después de salvar las bandejas de cartón, se hace buena amiga de una vendedora de nachos llamada Gertie (Nicole Byer), a quien le cuenta su dilema respecto a cómo se siente al lado de Marcy y esta le recomienda pretender que es lista. Siguiendo su consejo, Anne lleva a Sprig y Marcy a las alcantarillas en busca de la última pista, pero acaban liberando a un cocodrilo que intenta comérselos. Los tres logran escapar de la alcantarilla, gracias a todas las personas a las que Anne conoció durante su aventura, así como a Hop Pop y Polly. Cuando los tres son rescatados, Sprig acaba desvelando a los demás cómo Anne se siente ahora al lado de Marcy, quien responde que ella misma también se siente celosa de Anne por cómo es capaz de hacer amigos casi sin esfuerzo. Anne acaba encontrando la última pista en uno de los nachos de Gertie, y el mensaje resulta ser que el Rey Andrias le pide a Marcy que les traiga a Anne y los Plantar, ya que quiere conocerlos.

Queriendo la experiencia auténtica de Newtopia, Anne y Polly fingen dolores de estómago con el fin de abandonar el autobús de tour en el que Hop Pop ha metido a toda la familia. Lo primero que hacen al salir es ir a un puesto de comida manejado por un salamandro llamado Jerry, que vende "wraps" picantes que resultan ser demasiado para las dos, haciendo que Anne y Polly respiren fuego y quemen por accidente el tejado del puesto. Las dos son perseguidas por Jerry y, después de evadirlo, deciden comprar colas artificiales. Sin embargo, la cola de Anne resulta ser demasiado grande y constantemente golpea a la gente, incluyendo a los guardias, que también las persiguen. Después de huir de los guardias, las dos acaban en un desfile al cual Anne se une al manejar la cabeza de una carroza. Anne juega por un rato con la cabeza de la carroza, ofendiendo por accidente a los locales porque la carroza y el desfile en general son para hacer honor a Igor the Brave, un héroe caído de Newtopia. Anne y Polly son perseguidas por los locales y también por los guardias y por Jerry, una vez se vuelven a cruzar en su camino. Las dos vuelven con Sprig y Hop Pop al autobús, buscando escapar de la multitud, pero las encuentran y Anne roba otro de los wraps de Jerry para dárselos a Polly, quien usa su respiración de fuego para espantar a la muchedumbre. La familia continúa con el tour. Mientras tanto, en la librería de Newtopia, después de no encontrar nada sobre la Caja de la Calamidad en la librería, Marcy y el Rey Andrias encuentran allí un pasadizo secreto que podría llevarles hasta donde esté la información de la Caja de la Calamidad.